Bez obzira da li se u spremnicima sakuplja kišnica, bunarska ili se koristi vodovodna voda, potrebno ju je dovesti u stanje mikrobiološke ispravnosti i eliminirati sve patogene mikroorganizme: viruse, bakterije, gljivice, spore, plijesni i alge. Na taj način voda će postati tehnološki ispravna, odnosno zdrava za piće ili neke druge namjene. Vrlo često veliki problem u spremnicima predstavlja nakupljeni biofilm (kolonija bakterija koje su se spojile u novu formu te se na taj način se štite od klornih preparata i nemoguće ih je ukloniti većinom kemijskih sredstava). U slučaju da se u spremniku nalaze i patogeni mikroorganizmi opasni po zdravlje, spremnike tretiramo visokotlačnim strojevima (mehaničko čišćenje) i dodatno ekološkim sredstvima koji imaju dokazano vrhunske rezultate i pokazali su se kao rijetki proizvodi koji mogu lako riješiti nastali problem u vodi sa Echerichiom coli, Pseudomonas aeruginosom te Legionellom.